Non devi copiare tutto su floppy anche perche' ti basterebbe fare il boot da floppy e poi accedere all'hd dove e' installato Vice per Dos oppure ccs64 per dos.
Questo funziona se l'HD, o una sua partizione, e' formattata FAT. DOS non vede le partizioni NTFS.
La cosa migliore e' copiare VICE per DOS o CCS64 per DOS su una partizione FAT, che eventualmente va creata. Altrimenti, usare una chiavetta USB per il boot invece di un floppy (quest'ultima e' una cosa che non ho mai fatto personalmente)